Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER63

Tnfrsf23, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 23, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf23Q9ER63 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf23Q9ER63 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf23Q9ER63 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf23Q9ER63 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms