Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fundc1Q9DB70 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fundc1Q9DB70 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fundc1Q9DB70 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fundc1Q9DB70 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fundc1Q9DB70 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fundc1Q9DB70 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fundc1Q9DB70 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fundc1Q9DB70 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fundc1Q9DB70 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fundc1Q9DB70 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Fundc1Q9DB70 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fundc1Q9DB70 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fundc1Q9DB70 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fundc1Q9DB70 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fundc1Q9DB70 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fundc1Q9DB70 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fundc1Q9DB70 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fundc1Q9DB70 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fundc1Q9DB70 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fundc1Q9DB70 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fundc1Q9DB70 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fundc1Q9DB70 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fundc1Q9DB70 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fundc1Q9DB70 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fundc1Q9DB70 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fundc1Q9DB70 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fundc1Q9DB70 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fundc1Q9DB70 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fundc1Q9DB70 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fundc1Q9DB70 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms