Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL3

Ccdc54, Coiled-coil domain-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc54Q9DAL3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc54Q9DAL3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc54Q9DAL3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms