Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tube1Q9D6T1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tube1Q9D6T1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tube1Q9D6T1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tube1Q9D6T1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tube1Q9D6T1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tube1Q9D6T1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tube1Q9D6T1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tube1Q9D6T1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tube1Q9D6T1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tube1Q9D6T1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tube1Q9D6T1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tube1Q9D6T1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tube1Q9D6T1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tube1Q9D6T1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tube1Q9D6T1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tube1Q9D6T1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tube1Q9D6T1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tube1Q9D6T1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tube1Q9D6T1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tube1Q9D6T1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tube1Q9D6T1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tube1Q9D6T1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tube1Q9D6T1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tube1Q9D6T1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tube1Q9D6T1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tube1Q9D6T1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tube1Q9D6T1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tube1Q9D6T1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tube1Q9D6T1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tube1Q9D6T1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tube1Q9D6T1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tube1Q9D6T1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tube1Q9D6T1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tube1Q9D6T1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tube1Q9D6T1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tube1Q9D6T1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tube1Q9D6T1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tube1Q9D6T1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tube1Q9D6T1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tube1Q9D6T1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tube1Q9D6T1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tube1Q9D6T1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tube1Q9D6T1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tube1Q9D6T1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tube1Q9D6T1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tube1Q9D6T1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tube1Q9D6T1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tube1Q9D6T1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tube1Q9D6T1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tube1Q9D6T1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tube1Q9D6T1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tube1Q9D6T1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tube1Q9D6T1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tube1Q9D6T1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tube1Q9D6T1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tube1Q9D6T1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tube1Q9D6T1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tube1Q9D6T1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tube1Q9D6T1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tube1Q9D6T1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tube1Q9D6T1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tube1Q9D6T1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tube1Q9D6T1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tube1Q9D6T1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tube1Q9D6T1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tube1Q9D6T1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tube1Q9D6T1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tube1Q9D6T1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tube1Q9D6T1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tube1Q9D6T1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tube1Q9D6T1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tube1Q9D6T1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tube1Q9D6T1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tube1Q9D6T1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tube1Q9D6T1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tube1Q9D6T1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tube1Q9D6T1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tube1Q9D6T1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tube1Q9D6T1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tube1Q9D6T1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tube1Q9D6T1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tube1Q9D6T1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tube1Q9D6T1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tube1Q9D6T1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tube1Q9D6T1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tube1Q9D6T1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tube1Q9D6T1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tube1Q9D6T1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tube1Q9D6T1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tube1Q9D6T1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tube1Q9D6T1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tube1Q9D6T1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tube1Q9D6T1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tube1Q9D6T1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tube1Q9D6T1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tube1Q9D6T1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tube1Q9D6T1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tube1Q9D6T1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tube1Q9D6T1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.3 ms