Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc94Q9D6J3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc94Q9D6J3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc94Q9D6J3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc94Q9D6J3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc94Q9D6J3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc94Q9D6J3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc94Q9D6J3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc94Q9D6J3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc94Q9D6J3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc94Q9D6J3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc94Q9D6J3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc94Q9D6J3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc94Q9D6J3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc94Q9D6J3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc94Q9D6J3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc94Q9D6J3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc94Q9D6J3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc94Q9D6J3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc94Q9D6J3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc94Q9D6J3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc94Q9D6J3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc94Q9D6J3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc94Q9D6J3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc94Q9D6J3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc94Q9D6J3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc94Q9D6J3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc94Q9D6J3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc94Q9D6J3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc94Q9D6J3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc94Q9D6J3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc94Q9D6J3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc94Q9D6J3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc94Q9D6J3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc94Q9D6J3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc94Q9D6J3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc94Q9D6J3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc94Q9D6J3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc94Q9D6J3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc94Q9D6J3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc94Q9D6J3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc94Q9D6J3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc94Q9D6J3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc94Q9D6J3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc94Q9D6J3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc94Q9D6J3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc94Q9D6J3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc94Q9D6J3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc94Q9D6J3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc94Q9D6J3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc94Q9D6J3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc94Q9D6J3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc94Q9D6J3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc94Q9D6J3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc94Q9D6J3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc94Q9D6J3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc94Q9D6J3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc94Q9D6J3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc94Q9D6J3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc94Q9D6J3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc94Q9D6J3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc94Q9D6J3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc94Q9D6J3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc94Q9D6J3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc94Q9D6J3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc94Q9D6J3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc94Q9D6J3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc94Q9D6J3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc94Q9D6J3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc94Q9D6J3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc94Q9D6J3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc94Q9D6J3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc94Q9D6J3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc94Q9D6J3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc94Q9D6J3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc94Q9D6J3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc94Q9D6J3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc94Q9D6J3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc94Q9D6J3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc94Q9D6J3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc94Q9D6J3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc94Q9D6J3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc94Q9D6J3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc94Q9D6J3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc94Q9D6J3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc94Q9D6J3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc94Q9D6J3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc94Q9D6J3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc94Q9D6J3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc94Q9D6J3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc94Q9D6J3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc94Q9D6J3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc94Q9D6J3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc94Q9D6J3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc94Q9D6J3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc94Q9D6J3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc94Q9D6J3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc94Q9D6J3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc94Q9D6J3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc94Q9D6J3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms