Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pfn4Q9D6I3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pfn4Q9D6I3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pfn4Q9D6I3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pfn4Q9D6I3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pfn4Q9D6I3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pfn4Q9D6I3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pfn4Q9D6I3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pfn4Q9D6I3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pfn4Q9D6I3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pfn4Q9D6I3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pfn4Q9D6I3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pfn4Q9D6I3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pfn4Q9D6I3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pfn4Q9D6I3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pfn4Q9D6I3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pfn4Q9D6I3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pfn4Q9D6I3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pfn4Q9D6I3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pfn4Q9D6I3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfn4Q9D6I3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pfn4Q9D6I3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pfn4Q9D6I3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pfn4Q9D6I3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pfn4Q9D6I3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pfn4Q9D6I3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pfn4Q9D6I3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pfn4Q9D6I3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pfn4Q9D6I3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pfn4Q9D6I3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pfn4Q9D6I3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms