Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PudpQ9D5U5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PudpQ9D5U5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PudpQ9D5U5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PudpQ9D5U5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PudpQ9D5U5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PudpQ9D5U5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PudpQ9D5U5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PudpQ9D5U5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PudpQ9D5U5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PudpQ9D5U5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PudpQ9D5U5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PudpQ9D5U5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PudpQ9D5U5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PudpQ9D5U5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PudpQ9D5U5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PudpQ9D5U5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PudpQ9D5U5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PudpQ9D5U5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PudpQ9D5U5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PudpQ9D5U5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PudpQ9D5U5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PudpQ9D5U5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PudpQ9D5U5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PudpQ9D5U5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PudpQ9D5U5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PudpQ9D5U5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PudpQ9D5U5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PudpQ9D5U5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PudpQ9D5U5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PudpQ9D5U5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PudpQ9D5U5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PudpQ9D5U5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PudpQ9D5U5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PudpQ9D5U5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PudpQ9D5U5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PudpQ9D5U5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PudpQ9D5U5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PudpQ9D5U5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PudpQ9D5U5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PudpQ9D5U5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PudpQ9D5U5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PudpQ9D5U5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PudpQ9D5U5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PudpQ9D5U5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PudpQ9D5U5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PudpQ9D5U5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PudpQ9D5U5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PudpQ9D5U5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PudpQ9D5U5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PudpQ9D5U5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PudpQ9D5U5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PudpQ9D5U5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PudpQ9D5U5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PudpQ9D5U5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PudpQ9D5U5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PudpQ9D5U5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PudpQ9D5U5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PudpQ9D5U5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PudpQ9D5U5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PudpQ9D5U5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PudpQ9D5U5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PudpQ9D5U5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PudpQ9D5U5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PudpQ9D5U5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PudpQ9D5U5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PudpQ9D5U5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PudpQ9D5U5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PudpQ9D5U5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PudpQ9D5U5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PudpQ9D5U5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PudpQ9D5U5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PudpQ9D5U5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PudpQ9D5U5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PudpQ9D5U5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PudpQ9D5U5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PudpQ9D5U5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PudpQ9D5U5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PudpQ9D5U5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PudpQ9D5U5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PudpQ9D5U5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PudpQ9D5U5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PudpQ9D5U5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PudpQ9D5U5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PudpQ9D5U5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PudpQ9D5U5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PudpQ9D5U5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PudpQ9D5U5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PudpQ9D5U5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PudpQ9D5U5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PudpQ9D5U5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PudpQ9D5U5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PudpQ9D5U5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PudpQ9D5U5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PudpQ9D5U5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PudpQ9D5U5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PudpQ9D5U5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PudpQ9D5U5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PudpQ9D5U5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PudpQ9D5U5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms