Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3404Q9D506 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3404Q9D506 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm3404Q9D506 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3404Q9D506 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3404Q9D506 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3404Q9D506 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3404Q9D506 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3404Q9D506 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3404Q9D506 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3404Q9D506 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3404Q9D506 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3404Q9D506 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3404Q9D506 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3404Q9D506 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3404Q9D506 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3404Q9D506 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3404Q9D506 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3404Q9D506 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3404Q9D506 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3404Q9D506 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3404Q9D506 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3404Q9D506 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3404Q9D506 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3404Q9D506 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3404Q9D506 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3404Q9D506 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3404Q9D506 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3404Q9D506 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3404Q9D506 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3404Q9D506 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3404Q9D506 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3404Q9D506 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3404Q9D506 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3404Q9D506 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3404Q9D506 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3404Q9D506 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms