Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H8

Cul2, Cullin-2, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul2Q9D4H8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cul2Q9D4H8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cul2Q9D4H8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cul2Q9D4H8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cul2Q9D4H8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cul2Q9D4H8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cul2Q9D4H8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cul2Q9D4H8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cul2Q9D4H8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cul2Q9D4H8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cul2Q9D4H8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cul2Q9D4H8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cul2Q9D4H8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cul2Q9D4H8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cul2Q9D4H8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cul2Q9D4H8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cul2Q9D4H8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cul2Q9D4H8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cul2Q9D4H8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cul2Q9D4H8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cul2Q9D4H8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cul2Q9D4H8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cul2Q9D4H8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cul2Q9D4H8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cul2Q9D4H8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cul2Q9D4H8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cul2Q9D4H8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cul2Q9D4H8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cul2Q9D4H8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cul2Q9D4H8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cul2Q9D4H8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cul2Q9D4H8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cul2Q9D4H8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cul2Q9D4H8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cul2Q9D4H8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cul2Q9D4H8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cul2Q9D4H8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cul2Q9D4H8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cul2Q9D4H8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cul2Q9D4H8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cul2Q9D4H8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cul2Q9D4H8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cul2Q9D4H8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cul2Q9D4H8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cul2Q9D4H8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cul2Q9D4H8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cul2Q9D4H8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cul2Q9D4H8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cul2Q9D4H8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cul2Q9D4H8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cul2Q9D4H8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cul2Q9D4H8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cul2Q9D4H8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cul2Q9D4H8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cul2Q9D4H8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cul2Q9D4H8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cul2Q9D4H8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cul2Q9D4H8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cul2Q9D4H8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cul2Q9D4H8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cul2Q9D4H8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cul2Q9D4H8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cul2Q9D4H8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cul2Q9D4H8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cul2Q9D4H8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cul2Q9D4H8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cul2Q9D4H8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cul2Q9D4H8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cul2Q9D4H8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cul2Q9D4H8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cul2Q9D4H8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cul2Q9D4H8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cul2Q9D4H8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cul2Q9D4H8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cul2Q9D4H8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cul2Q9D4H8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cul2Q9D4H8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cul2Q9D4H8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cul2Q9D4H8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cul2Q9D4H8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cul2Q9D4H8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cul2Q9D4H8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cul2Q9D4H8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cul2Q9D4H8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cul2Q9D4H8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cul2Q9D4H8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cul2Q9D4H8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cul2Q9D4H8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cul2Q9D4H8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cul2Q9D4H8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cul2Q9D4H8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cul2Q9D4H8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cul2Q9D4H8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cul2Q9D4H8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cul2Q9D4H8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cul2Q9D4H8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cul2Q9D4H8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cul2Q9D4H8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cul2Q9D4H8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cul2Q9D4H8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 196.6 ms