Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snrnp35Q9D384 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snrnp35Q9D384 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snrnp35Q9D384 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snrnp35Q9D384 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snrnp35Q9D384 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Snrnp35Q9D384 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Snrnp35Q9D384 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Snrnp35Q9D384 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snrnp35Q9D384 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snrnp35Q9D384 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snrnp35Q9D384 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snrnp35Q9D384 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snrnp35Q9D384 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snrnp35Q9D384 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snrnp35Q9D384 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snrnp35Q9D384 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snrnp35Q9D384 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snrnp35Q9D384 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snrnp35Q9D384 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snrnp35Q9D384 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Snrnp35Q9D384 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Snrnp35Q9D384 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snrnp35Q9D384 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snrnp35Q9D384 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snrnp35Q9D384 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snrnp35Q9D384 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snrnp35Q9D384 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snrnp35Q9D384 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snrnp35Q9D384 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snrnp35Q9D384 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snrnp35Q9D384 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snrnp35Q9D384 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snrnp35Q9D384 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snrnp35Q9D384 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snrnp35Q9D384 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snrnp35Q9D384 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Snrnp35Q9D384 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Snrnp35Q9D384 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snrnp35Q9D384 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snrnp35Q9D384 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Snrnp35Q9D384 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snrnp35Q9D384 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snrnp35Q9D384 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snrnp35Q9D384 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snrnp35Q9D384 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snrnp35Q9D384 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snrnp35Q9D384 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snrnp35Q9D384 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snrnp35Q9D384 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snrnp35Q9D384 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snrnp35Q9D384 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snrnp35Q9D384 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snrnp35Q9D384 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snrnp35Q9D384 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snrnp35Q9D384 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snrnp35Q9D384 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snrnp35Q9D384 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snrnp35Q9D384 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Snrnp35Q9D384 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snrnp35Q9D384 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snrnp35Q9D384 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snrnp35Q9D384 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snrnp35Q9D384 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snrnp35Q9D384 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Snrnp35Q9D384 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snrnp35Q9D384 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Snrnp35Q9D384 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snrnp35Q9D384 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snrnp35Q9D384 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snrnp35Q9D384 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snrnp35Q9D384 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snrnp35Q9D384 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snrnp35Q9D384 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snrnp35Q9D384 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snrnp35Q9D384 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snrnp35Q9D384 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snrnp35Q9D384 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Snrnp35Q9D384 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snrnp35Q9D384 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snrnp35Q9D384 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snrnp35Q9D384 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snrnp35Q9D384 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snrnp35Q9D384 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snrnp35Q9D384 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Snrnp35Q9D384 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Snrnp35Q9D384 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snrnp35Q9D384 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snrnp35Q9D384 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snrnp35Q9D384 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snrnp35Q9D384 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snrnp35Q9D384 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snrnp35Q9D384 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snrnp35Q9D384 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snrnp35Q9D384 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snrnp35Q9D384 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Snrnp35Q9D384 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snrnp35Q9D384 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snrnp35Q9D384 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snrnp35Q9D384 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms