Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2T6

1700034E13Rik, RIKEN cDNA 1700034E13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700034E13RikQ9D2T6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700034E13RikQ9D2T6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700034E13RikQ9D2T6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700034E13RikQ9D2T6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700034E13RikQ9D2T6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700034E13RikQ9D2T6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700034E13RikQ9D2T6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700034E13RikQ9D2T6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700034E13RikQ9D2T6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700034E13RikQ9D2T6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700034E13RikQ9D2T6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700034E13RikQ9D2T6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700034E13RikQ9D2T6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700034E13RikQ9D2T6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700034E13RikQ9D2T6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700034E13RikQ9D2T6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700034E13RikQ9D2T6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
1700034E13RikQ9D2T6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
1700034E13RikQ9D2T6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
1700034E13RikQ9D2T6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
1700034E13RikQ9D2T6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700034E13RikQ9D2T6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms