Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1R9

Rpl34, 60S ribosomal protein L34, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl34Q9D1R9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl34Q9D1R9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl34Q9D1R9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl34Q9D1R9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl34Q9D1R9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpl34Q9D1R9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpl34Q9D1R9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpl34Q9D1R9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpl34Q9D1R9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpl34Q9D1R9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpl34Q9D1R9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpl34Q9D1R9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpl34Q9D1R9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpl34Q9D1R9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpl34Q9D1R9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpl34Q9D1R9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpl34Q9D1R9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpl34Q9D1R9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpl34Q9D1R9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpl34Q9D1R9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpl34Q9D1R9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpl34Q9D1R9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpl34Q9D1R9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpl34Q9D1R9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpl34Q9D1R9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpl34Q9D1R9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpl34Q9D1R9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpl34Q9D1R9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpl34Q9D1R9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpl34Q9D1R9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpl34Q9D1R9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpl34Q9D1R9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpl34Q9D1R9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpl34Q9D1R9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpl34Q9D1R9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpl34Q9D1R9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpl34Q9D1R9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpl34Q9D1R9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpl34Q9D1R9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpl34Q9D1R9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpl34Q9D1R9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpl34Q9D1R9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpl34Q9D1R9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpl34Q9D1R9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpl34Q9D1R9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpl34Q9D1R9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpl34Q9D1R9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpl34Q9D1R9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpl34Q9D1R9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpl34Q9D1R9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpl34Q9D1R9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpl34Q9D1R9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpl34Q9D1R9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpl34Q9D1R9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpl34Q9D1R9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpl34Q9D1R9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpl34Q9D1R9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpl34Q9D1R9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpl34Q9D1R9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpl34Q9D1R9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpl34Q9D1R9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpl34Q9D1R9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpl34Q9D1R9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpl34Q9D1R9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpl34Q9D1R9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpl34Q9D1R9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpl34Q9D1R9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpl34Q9D1R9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rpl34Q9D1R9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rpl34Q9D1R9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rpl34Q9D1R9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpl34Q9D1R9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpl34Q9D1R9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpl34Q9D1R9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpl34Q9D1R9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpl34Q9D1R9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl34Q9D1R9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl34Q9D1R9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl34Q9D1R9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl34Q9D1R9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl34Q9D1R9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl34Q9D1R9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl34Q9D1R9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl34Q9D1R9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl34Q9D1R9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl34Q9D1R9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl34Q9D1R9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl34Q9D1R9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl34Q9D1R9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl34Q9D1R9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl34Q9D1R9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl34Q9D1R9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl34Q9D1R9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl34Q9D1R9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl34Q9D1R9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl34Q9D1R9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl34Q9D1R9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl34Q9D1R9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl34Q9D1R9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpl34Q9D1R9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms