Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Syf2Q9D198 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Syf2Q9D198 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syf2Q9D198 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syf2Q9D198 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syf2Q9D198 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syf2Q9D198 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syf2Q9D198 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syf2Q9D198 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syf2Q9D198 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syf2Q9D198 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syf2Q9D198 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syf2Q9D198 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syf2Q9D198 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syf2Q9D198 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syf2Q9D198 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syf2Q9D198 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syf2Q9D198 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syf2Q9D198 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syf2Q9D198 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Syf2Q9D198 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syf2Q9D198 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syf2Q9D198 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syf2Q9D198 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syf2Q9D198 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syf2Q9D198 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syf2Q9D198 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syf2Q9D198 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syf2Q9D198 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syf2Q9D198 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syf2Q9D198 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syf2Q9D198 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syf2Q9D198 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syf2Q9D198 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syf2Q9D198 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syf2Q9D198 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syf2Q9D198 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syf2Q9D198 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syf2Q9D198 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syf2Q9D198 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syf2Q9D198 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syf2Q9D198 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syf2Q9D198 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syf2Q9D198 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syf2Q9D198 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syf2Q9D198 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Syf2Q9D198 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syf2Q9D198 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Syf2Q9D198 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syf2Q9D198 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syf2Q9D198 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syf2Q9D198 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Syf2Q9D198 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syf2Q9D198 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syf2Q9D198 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Syf2Q9D198 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syf2Q9D198 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syf2Q9D198 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syf2Q9D198 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syf2Q9D198 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syf2Q9D198 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syf2Q9D198 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syf2Q9D198 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syf2Q9D198 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms