Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hddc3Q9D114 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hddc3Q9D114 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hddc3Q9D114 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hddc3Q9D114 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hddc3Q9D114 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hddc3Q9D114 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hddc3Q9D114 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hddc3Q9D114 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hddc3Q9D114 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hddc3Q9D114 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hddc3Q9D114 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hddc3Q9D114 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hddc3Q9D114 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hddc3Q9D114 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Hddc3Q9D114 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hddc3Q9D114 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hddc3Q9D114 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hddc3Q9D114 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hddc3Q9D114 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hddc3Q9D114 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hddc3Q9D114 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hddc3Q9D114 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hddc3Q9D114 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hddc3Q9D114 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hddc3Q9D114 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hddc3Q9D114 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hddc3Q9D114 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hddc3Q9D114 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Hddc3Q9D114 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hddc3Q9D114 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hddc3Q9D114 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hddc3Q9D114 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hddc3Q9D114 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Hddc3Q9D114 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hddc3Q9D114 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hddc3Q9D114 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hddc3Q9D114 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hddc3Q9D114 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hddc3Q9D114 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hddc3Q9D114 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hddc3Q9D114 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Hddc3Q9D114 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hddc3Q9D114 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hddc3Q9D114 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hddc3Q9D114 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hddc3Q9D114 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hddc3Q9D114 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hddc3Q9D114 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hddc3Q9D114 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Hddc3Q9D114 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hddc3Q9D114 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
Hddc3Q9D114 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hddc3Q9D114 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Hddc3Q9D114 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hddc3Q9D114 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hddc3Q9D114 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hddc3Q9D114 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hddc3Q9D114 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hddc3Q9D114 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Hddc3Q9D114 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hddc3Q9D114 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Hddc3Q9D114 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hddc3Q9D114 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Hddc3Q9D114 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hddc3Q9D114 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hddc3Q9D114 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hddc3Q9D114 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hddc3Q9D114 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hddc3Q9D114 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hddc3Q9D114 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Hddc3Q9D114 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Hddc3Q9D114 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Hddc3Q9D114 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hddc3Q9D114 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hddc3Q9D114 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hddc3Q9D114 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hddc3Q9D114 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hddc3Q9D114 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hddc3Q9D114 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hddc3Q9D114 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Hddc3Q9D114 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hddc3Q9D114 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hddc3Q9D114 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hddc3Q9D114 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hddc3Q9D114 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hddc3Q9D114 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hddc3Q9D114 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hddc3Q9D114 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hddc3Q9D114 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hddc3Q9D114 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hddc3Q9D114 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hddc3Q9D114 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hddc3Q9D114 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hddc3Q9D114 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hddc3Q9D114 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hddc3Q9D114 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hddc3Q9D114 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hddc3Q9D114 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hddc3Q9D114 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.5 ms