Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem88Q9D0N8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms