Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rfc5Q9D0F6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfc5Q9D0F6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfc5Q9D0F6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfc5Q9D0F6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfc5Q9D0F6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfc5Q9D0F6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfc5Q9D0F6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfc5Q9D0F6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfc5Q9D0F6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfc5Q9D0F6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfc5Q9D0F6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfc5Q9D0F6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rfc5Q9D0F6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rfc5Q9D0F6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rfc5Q9D0F6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rfc5Q9D0F6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rfc5Q9D0F6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rfc5Q9D0F6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rfc5Q9D0F6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rfc5Q9D0F6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfc5Q9D0F6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfc5Q9D0F6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfc5Q9D0F6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfc5Q9D0F6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfc5Q9D0F6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfc5Q9D0F6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfc5Q9D0F6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfc5Q9D0F6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfc5Q9D0F6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfc5Q9D0F6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfc5Q9D0F6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfc5Q9D0F6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfc5Q9D0F6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfc5Q9D0F6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfc5Q9D0F6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfc5Q9D0F6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfc5Q9D0F6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfc5Q9D0F6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfc5Q9D0F6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfc5Q9D0F6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfc5Q9D0F6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfc5Q9D0F6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfc5Q9D0F6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfc5Q9D0F6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfc5Q9D0F6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfc5Q9D0F6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfc5Q9D0F6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfc5Q9D0F6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfc5Q9D0F6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfc5Q9D0F6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfc5Q9D0F6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfc5Q9D0F6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfc5Q9D0F6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfc5Q9D0F6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfc5Q9D0F6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfc5Q9D0F6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfc5Q9D0F6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfc5Q9D0F6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfc5Q9D0F6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfc5Q9D0F6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfc5Q9D0F6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfc5Q9D0F6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfc5Q9D0F6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfc5Q9D0F6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfc5Q9D0F6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfc5Q9D0F6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rfc5Q9D0F6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rfc5Q9D0F6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rfc5Q9D0F6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rfc5Q9D0F6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rfc5Q9D0F6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rfc5Q9D0F6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rfc5Q9D0F6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rfc5Q9D0F6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfc5Q9D0F6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfc5Q9D0F6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfc5Q9D0F6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfc5Q9D0F6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfc5Q9D0F6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfc5Q9D0F6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfc5Q9D0F6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfc5Q9D0F6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfc5Q9D0F6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfc5Q9D0F6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfc5Q9D0F6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfc5Q9D0F6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfc5Q9D0F6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfc5Q9D0F6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfc5Q9D0F6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfc5Q9D0F6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfc5Q9D0F6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfc5Q9D0F6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfc5Q9D0F6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfc5Q9D0F6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfc5Q9D0F6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfc5Q9D0F6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfc5Q9D0F6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfc5Q9D0F6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfc5Q9D0F6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms