Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sgo1Q9CXH7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sgo1Q9CXH7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sgo1Q9CXH7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sgo1Q9CXH7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sgo1Q9CXH7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sgo1Q9CXH7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sgo1Q9CXH7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sgo1Q9CXH7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sgo1Q9CXH7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sgo1Q9CXH7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sgo1Q9CXH7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sgo1Q9CXH7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sgo1Q9CXH7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sgo1Q9CXH7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sgo1Q9CXH7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sgo1Q9CXH7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sgo1Q9CXH7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sgo1Q9CXH7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sgo1Q9CXH7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sgo1Q9CXH7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sgo1Q9CXH7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sgo1Q9CXH7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sgo1Q9CXH7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.8 ms