Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9CWU4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9CWU4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9CWU4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9CWU4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9CWU4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9CWU4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9CWU4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9CWU4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9CWU4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9CWU4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9CWU4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9CWU4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q9CWU4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q9CWU4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9CWU4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9CWU4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9CWU4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9CWU4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9CWU4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9CWU4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9CWU4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9CWU4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9CWU4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9CWU4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9CWU4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9CWU4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9CWU4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9CWU4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9CWU4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9CWU4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9CWU4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9CWU4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9CWU4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9CWU4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9CWU4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9CWU4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9CWU4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9CWU4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9CWU4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9CWU4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9CWU4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9CWU4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9CWU4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9CWU4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9CWU4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9CWU4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9CWU4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9CWU4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9CWU4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9CWU4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9CWU4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9CWU4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9CWU4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9CWU4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9CWU4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9CWU4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9CWU4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9CWU4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9CWU4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9CWU4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9CWU4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9CWU4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9CWU4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q9CWU4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9CWU4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9CWU4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9CWU4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9CWU4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9CWU4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9CWU4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9CWU4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9CWU4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9CWU4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9CWU4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9CWU4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9CWU4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9CWU4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9CWU4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9CWU4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9CWU4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9CWU4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9CWU4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9CWU4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9CWU4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9CWU4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9CWU4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9CWU4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9CWU4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9CWU4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9CWU4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9CWU4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9CWU4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9CWU4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9CWU4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9CWU4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9CWU4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9CWU4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9CWU4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9CWU4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.1 ms