Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRZ8

Tspo2, Translocator protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspo2Q9CRZ8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspo2Q9CRZ8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspo2Q9CRZ8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspo2Q9CRZ8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms