Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR08

Pop4, Ribonuclease P protein subunit p29, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop4Q9CR08 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Pop4Q9CR08 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pop4Q9CR08 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pop4Q9CR08 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pop4Q9CR08 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pop4Q9CR08 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Pop4Q9CR08 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Pop4Q9CR08 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pop4Q9CR08 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pop4Q9CR08 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pop4Q9CR08 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pop4Q9CR08 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pop4Q9CR08 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pop4Q9CR08 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pop4Q9CR08 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pop4Q9CR08 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pop4Q9CR08 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pop4Q9CR08 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pop4Q9CR08 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pop4Q9CR08 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pop4Q9CR08 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pop4Q9CR08 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pop4Q9CR08 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Pop4Q9CR08 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Pop4Q9CR08 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pop4Q9CR08 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Pop4Q9CR08 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pop4Q9CR08 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pop4Q9CR08 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pop4Q9CR08 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pop4Q9CR08 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pop4Q9CR08 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pop4Q9CR08 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pop4Q9CR08 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Pop4Q9CR08 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pop4Q9CR08 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pop4Q9CR08 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pop4Q9CR08 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pop4Q9CR08 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pop4Q9CR08 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pop4Q9CR08 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pop4Q9CR08 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pop4Q9CR08 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pop4Q9CR08 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pop4Q9CR08 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pop4Q9CR08 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pop4Q9CR08 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pop4Q9CR08 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pop4Q9CR08 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pop4Q9CR08 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
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