Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ1

Ccdc198, Uncharacterized protein CCDC198, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc198Q9CPZ1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc198Q9CPZ1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc198Q9CPZ1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc198Q9CPZ1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc198Q9CPZ1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc198Q9CPZ1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc198Q9CPZ1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc198Q9CPZ1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc198Q9CPZ1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc198Q9CPZ1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc198Q9CPZ1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc198Q9CPZ1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc198Q9CPZ1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc198Q9CPZ1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc198Q9CPZ1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc198Q9CPZ1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc198Q9CPZ1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc198Q9CPZ1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc198Q9CPZ1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc198Q9CPZ1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc198Q9CPZ1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc198Q9CPZ1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc198Q9CPZ1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc198Q9CPZ1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc198Q9CPZ1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc198Q9CPZ1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc198Q9CPZ1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc198Q9CPZ1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc198Q9CPZ1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc198Q9CPZ1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms