Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rims1Q99NE5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rims1Q99NE5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Rims1Q99NE5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Rims1Q99NE5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rims1Q99NE5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rims1Q99NE5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rims1Q99NE5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rims1Q99NE5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rims1Q99NE5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rims1Q99NE5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Rims1Q99NE5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rims1Q99NE5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rims1Q99NE5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rims1Q99NE5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rims1Q99NE5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rims1Q99NE5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rims1Q99NE5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rims1Q99NE5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rims1Q99NE5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rims1Q99NE5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rims1Q99NE5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rims1Q99NE5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rims1Q99NE5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rims1Q99NE5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rims1Q99NE5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rims1Q99NE5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rims1Q99NE5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Rims1Q99NE5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rims1Q99NE5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rims1Q99NE5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Rims1Q99NE5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rims1Q99NE5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rims1Q99NE5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rims1Q99NE5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rims1Q99NE5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rims1Q99NE5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rims1Q99NE5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rims1Q99NE5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rims1Q99NE5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rims1Q99NE5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rims1Q99NE5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rims1Q99NE5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rims1Q99NE5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rims1Q99NE5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rims1Q99NE5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rims1Q99NE5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rims1Q99NE5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rims1Q99NE5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Rims1Q99NE5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rims1Q99NE5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rims1Q99NE5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rims1Q99NE5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rims1Q99NE5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rims1Q99NE5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Rims1Q99NE5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rims1Q99NE5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rims1Q99NE5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rims1Q99NE5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rims1Q99NE5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rims1Q99NE5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rims1Q99NE5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rims1Q99NE5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rims1Q99NE5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rims1Q99NE5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rims1Q99NE5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rims1Q99NE5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rims1Q99NE5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rims1Q99NE5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rims1Q99NE5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rims1Q99NE5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Rims1Q99NE5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rims1Q99NE5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rims1Q99NE5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rims1Q99NE5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rims1Q99NE5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rims1Q99NE5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rims1Q99NE5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rims1Q99NE5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rims1Q99NE5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rims1Q99NE5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rims1Q99NE5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rims1Q99NE5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rims1Q99NE5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rims1Q99NE5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rims1Q99NE5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rims1Q99NE5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rims1Q99NE5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rims1Q99NE5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rims1Q99NE5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rims1Q99NE5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Rims1Q99NE5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Rims1Q99NE5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rims1Q99NE5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rims1Q99NE5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rims1Q99NE5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rims1Q99NE5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rims1Q99NE5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Rims1Q99NE5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rims1Q99NE5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 741.3 ms