Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tdrd1Q99MV1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tdrd1Q99MV1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tdrd1Q99MV1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tdrd1Q99MV1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tdrd1Q99MV1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Tdrd1Q99MV1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tdrd1Q99MV1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tdrd1Q99MV1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tdrd1Q99MV1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Tdrd1Q99MV1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tdrd1Q99MV1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tdrd1Q99MV1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tdrd1Q99MV1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tdrd1Q99MV1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tdrd1Q99MV1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tdrd1Q99MV1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tdrd1Q99MV1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tdrd1Q99MV1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tdrd1Q99MV1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tdrd1Q99MV1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tdrd1Q99MV1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tdrd1Q99MV1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tdrd1Q99MV1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tdrd1Q99MV1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tdrd1Q99MV1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tdrd1Q99MV1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tdrd1Q99MV1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tdrd1Q99MV1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tdrd1Q99MV1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tdrd1Q99MV1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tdrd1Q99MV1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tdrd1Q99MV1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tdrd1Q99MV1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tdrd1Q99MV1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tdrd1Q99MV1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tdrd1Q99MV1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tdrd1Q99MV1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tdrd1Q99MV1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tdrd1Q99MV1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tdrd1Q99MV1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tdrd1Q99MV1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tdrd1Q99MV1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tdrd1Q99MV1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tdrd1Q99MV1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tdrd1Q99MV1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tdrd1Q99MV1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Tdrd1Q99MV1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tdrd1Q99MV1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tdrd1Q99MV1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tdrd1Q99MV1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Tdrd1Q99MV1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tdrd1Q99MV1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tdrd1Q99MV1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tdrd1Q99MV1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tdrd1Q99MV1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tdrd1Q99MV1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tdrd1Q99MV1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tdrd1Q99MV1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tdrd1Q99MV1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tdrd1Q99MV1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tdrd1Q99MV1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Tdrd1Q99MV1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tdrd1Q99MV1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tdrd1Q99MV1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Tdrd1Q99MV1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tdrd1Q99MV1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Tdrd1Q99MV1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tdrd1Q99MV1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tdrd1Q99MV1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tdrd1Q99MV1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tdrd1Q99MV1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tdrd1Q99MV1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tdrd1Q99MV1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tdrd1Q99MV1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tdrd1Q99MV1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tdrd1Q99MV1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tdrd1Q99MV1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tdrd1Q99MV1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Tdrd1Q99MV1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tdrd1Q99MV1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tdrd1Q99MV1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tdrd1Q99MV1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tdrd1Q99MV1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tdrd1Q99MV1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tdrd1Q99MV1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Tdrd1Q99MV1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tdrd1Q99MV1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Tdrd1Q99MV1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tdrd1Q99MV1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tdrd1Q99MV1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tdrd1Q99MV1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tdrd1Q99MV1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tdrd1Q99MV1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tdrd1Q99MV1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tdrd1Q99MV1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tdrd1Q99MV1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tdrd1Q99MV1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tdrd1Q99MV1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tdrd1Q99MV1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms