Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP3

Calcb, Calcitonin gene-related peptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CalcbQ99MP3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CalcbQ99MP3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CalcbQ99MP3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CalcbQ99MP3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CalcbQ99MP3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CalcbQ99MP3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CalcbQ99MP3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CalcbQ99MP3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CalcbQ99MP3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CalcbQ99MP3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CalcbQ99MP3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CalcbQ99MP3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CalcbQ99MP3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CalcbQ99MP3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CalcbQ99MP3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CalcbQ99MP3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CalcbQ99MP3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CalcbQ99MP3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CalcbQ99MP3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CalcbQ99MP3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CalcbQ99MP3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CalcbQ99MP3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CalcbQ99MP3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CalcbQ99MP3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CalcbQ99MP3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CalcbQ99MP3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CalcbQ99MP3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CalcbQ99MP3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CalcbQ99MP3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CalcbQ99MP3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CalcbQ99MP3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CalcbQ99MP3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CalcbQ99MP3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CalcbQ99MP3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CalcbQ99MP3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CalcbQ99MP3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CalcbQ99MP3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CalcbQ99MP3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CalcbQ99MP3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CalcbQ99MP3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CalcbQ99MP3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms