Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN1

Kars, Lysine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KarsQ99MN1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KarsQ99MN1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KarsQ99MN1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KarsQ99MN1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KarsQ99MN1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KarsQ99MN1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KarsQ99MN1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
KarsQ99MN1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KarsQ99MN1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KarsQ99MN1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KarsQ99MN1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
KarsQ99MN1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
KarsQ99MN1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KarsQ99MN1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KarsQ99MN1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KarsQ99MN1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KarsQ99MN1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KarsQ99MN1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KarsQ99MN1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KarsQ99MN1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KarsQ99MN1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KarsQ99MN1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KarsQ99MN1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KarsQ99MN1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KarsQ99MN1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KarsQ99MN1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KarsQ99MN1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KarsQ99MN1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KarsQ99MN1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KarsQ99MN1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KarsQ99MN1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KarsQ99MN1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KarsQ99MN1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KarsQ99MN1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KarsQ99MN1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KarsQ99MN1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KarsQ99MN1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KarsQ99MN1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KarsQ99MN1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KarsQ99MN1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KarsQ99MN1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KarsQ99MN1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KarsQ99MN1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KarsQ99MN1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KarsQ99MN1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KarsQ99MN1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KarsQ99MN1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KarsQ99MN1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KarsQ99MN1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KarsQ99MN1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KarsQ99MN1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KarsQ99MN1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KarsQ99MN1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KarsQ99MN1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KarsQ99MN1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KarsQ99MN1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
KarsQ99MN1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
KarsQ99MN1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KarsQ99MN1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KarsQ99MN1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KarsQ99MN1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KarsQ99MN1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KarsQ99MN1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KarsQ99MN1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KarsQ99MN1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KarsQ99MN1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KarsQ99MN1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KarsQ99MN1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KarsQ99MN1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KarsQ99MN1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
KarsQ99MN1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KarsQ99MN1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KarsQ99MN1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KarsQ99MN1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KarsQ99MN1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KarsQ99MN1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KarsQ99MN1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KarsQ99MN1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KarsQ99MN1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KarsQ99MN1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KarsQ99MN1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KarsQ99MN1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KarsQ99MN1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KarsQ99MN1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KarsQ99MN1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KarsQ99MN1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KarsQ99MN1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KarsQ99MN1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KarsQ99MN1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KarsQ99MN1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KarsQ99MN1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KarsQ99MN1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KarsQ99MN1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KarsQ99MN1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KarsQ99MN1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KarsQ99MN1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KarsQ99MN1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
KarsQ99MN1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
KarsQ99MN1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KarsQ99MN1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms