Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Atp1b4Q99ME6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Atp1b4Q99ME6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Atp1b4Q99ME6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Atp1b4Q99ME6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Atp1b4Q99ME6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Atp1b4Q99ME6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Atp1b4Q99ME6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Atp1b4Q99ME6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Atp1b4Q99ME6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Atp1b4Q99ME6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Atp1b4Q99ME6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Atp1b4Q99ME6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Atp1b4Q99ME6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Atp1b4Q99ME6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Atp1b4Q99ME6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Atp1b4Q99ME6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Atp1b4Q99ME6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Atp1b4Q99ME6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Atp1b4Q99ME6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Atp1b4Q99ME6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Atp1b4Q99ME6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Atp1b4Q99ME6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Atp1b4Q99ME6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Atp1b4Q99ME6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Atp1b4Q99ME6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Atp1b4Q99ME6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Atp1b4Q99ME6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Atp1b4Q99ME6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Atp1b4Q99ME6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Atp1b4Q99ME6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Atp1b4Q99ME6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Atp1b4Q99ME6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Atp1b4Q99ME6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Atp1b4Q99ME6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Atp1b4Q99ME6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Atp1b4Q99ME6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Atp1b4Q99ME6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Atp1b4Q99ME6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Atp1b4Q99ME6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Atp1b4Q99ME6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Atp1b4Q99ME6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Atp1b4Q99ME6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Atp1b4Q99ME6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Atp1b4Q99ME6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Atp1b4Q99ME6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Atp1b4Q99ME6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Atp1b4Q99ME6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Atp1b4Q99ME6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Atp1b4Q99ME6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Atp1b4Q99ME6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Atp1b4Q99ME6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Atp1b4Q99ME6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Atp1b4Q99ME6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Atp1b4Q99ME6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Atp1b4Q99ME6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Atp1b4Q99ME6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Atp1b4Q99ME6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Atp1b4Q99ME6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Atp1b4Q99ME6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Atp1b4Q99ME6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Atp1b4Q99ME6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Atp1b4Q99ME6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Atp1b4Q99ME6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Atp1b4Q99ME6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Atp1b4Q99ME6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Atp1b4Q99ME6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Atp1b4Q99ME6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Atp1b4Q99ME6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Atp1b4Q99ME6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Atp1b4Q99ME6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Atp1b4Q99ME6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Atp1b4Q99ME6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Atp1b4Q99ME6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Atp1b4Q99ME6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Atp1b4Q99ME6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Atp1b4Q99ME6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Atp1b4Q99ME6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Atp1b4Q99ME6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Atp1b4Q99ME6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Atp1b4Q99ME6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Atp1b4Q99ME6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Atp1b4Q99ME6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Atp1b4Q99ME6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Atp1b4Q99ME6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Atp1b4Q99ME6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Atp1b4Q99ME6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Atp1b4Q99ME6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Atp1b4Q99ME6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Atp1b4Q99ME6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Atp1b4Q99ME6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Atp1b4Q99ME6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Atp1b4Q99ME6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Atp1b4Q99ME6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Atp1b4Q99ME6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Atp1b4Q99ME6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Atp1b4Q99ME6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Atp1b4Q99ME6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Atp1b4Q99ME6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Atp1b4Q99ME6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms