Protein–RNA interactions for Protein: Q99K51

Pls3, Plastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pls3Q99K51 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pls3Q99K51 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pls3Q99K51 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pls3Q99K51 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pls3Q99K51 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pls3Q99K51 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pls3Q99K51 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pls3Q99K51 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pls3Q99K51 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pls3Q99K51 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pls3Q99K51 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pls3Q99K51 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pls3Q99K51 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pls3Q99K51 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pls3Q99K51 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pls3Q99K51 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pls3Q99K51 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pls3Q99K51 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pls3Q99K51 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pls3Q99K51 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pls3Q99K51 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pls3Q99K51 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pls3Q99K51 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pls3Q99K51 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pls3Q99K51 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pls3Q99K51 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pls3Q99K51 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pls3Q99K51 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pls3Q99K51 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pls3Q99K51 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pls3Q99K51 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pls3Q99K51 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pls3Q99K51 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pls3Q99K51 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pls3Q99K51 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pls3Q99K51 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pls3Q99K51 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pls3Q99K51 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pls3Q99K51 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pls3Q99K51 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pls3Q99K51 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pls3Q99K51 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pls3Q99K51 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pls3Q99K51 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pls3Q99K51 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pls3Q99K51 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pls3Q99K51 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pls3Q99K51 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pls3Q99K51 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pls3Q99K51 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pls3Q99K51 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pls3Q99K51 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pls3Q99K51 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pls3Q99K51 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pls3Q99K51 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pls3Q99K51 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pls3Q99K51 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pls3Q99K51 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pls3Q99K51 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pls3Q99K51 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pls3Q99K51 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pls3Q99K51 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pls3Q99K51 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pls3Q99K51 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pls3Q99K51 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pls3Q99K51 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pls3Q99K51 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pls3Q99K51 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pls3Q99K51 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pls3Q99K51 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pls3Q99K51 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pls3Q99K51 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pls3Q99K51 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pls3Q99K51 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pls3Q99K51 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pls3Q99K51 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pls3Q99K51 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pls3Q99K51 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pls3Q99K51 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pls3Q99K51 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pls3Q99K51 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pls3Q99K51 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pls3Q99K51 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pls3Q99K51 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pls3Q99K51 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pls3Q99K51 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pls3Q99K51 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pls3Q99K51 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pls3Q99K51 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pls3Q99K51 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pls3Q99K51 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pls3Q99K51 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pls3Q99K51 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pls3Q99K51 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pls3Q99K51 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pls3Q99K51 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pls3Q99K51 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pls3Q99K51 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pls3Q99K51 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pls3Q99K51 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms