Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp11Q99K46 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp11Q99K46 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp11Q99K46 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp11Q99K46 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp11Q99K46 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp11Q99K46 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp11Q99K46 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp11Q99K46 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp11Q99K46 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp11Q99K46 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp11Q99K46 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp11Q99K46 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp11Q99K46 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp11Q99K46 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp11Q99K46 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp11Q99K46 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp11Q99K46 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp11Q99K46 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp11Q99K46 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp11Q99K46 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp11Q99K46 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp11Q99K46 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp11Q99K46 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp11Q99K46 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp11Q99K46 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp11Q99K46 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp11Q99K46 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp11Q99K46 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp11Q99K46 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp11Q99K46 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp11Q99K46 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Usp11Q99K46 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Usp11Q99K46 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp11Q99K46 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp11Q99K46 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp11Q99K46 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp11Q99K46 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp11Q99K46 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp11Q99K46 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp11Q99K46 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp11Q99K46 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp11Q99K46 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp11Q99K46 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp11Q99K46 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp11Q99K46 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp11Q99K46 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp11Q99K46 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp11Q99K46 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp11Q99K46 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp11Q99K46 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp11Q99K46 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp11Q99K46 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp11Q99K46 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp11Q99K46 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp11Q99K46 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp11Q99K46 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp11Q99K46 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp11Q99K46 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp11Q99K46 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp11Q99K46 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp11Q99K46 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp11Q99K46 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp11Q99K46 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp11Q99K46 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp11Q99K46 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp11Q99K46 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp11Q99K46 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp11Q99K46 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp11Q99K46 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp11Q99K46 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp11Q99K46 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp11Q99K46 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp11Q99K46 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp11Q99K46 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp11Q99K46 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp11Q99K46 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp11Q99K46 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp11Q99K46 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp11Q99K46 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp11Q99K46 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp11Q99K46 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp11Q99K46 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp11Q99K46 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp11Q99K46 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp11Q99K46 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp11Q99K46 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp11Q99K46 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp11Q99K46 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp11Q99K46 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp11Q99K46 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp11Q99K46 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp11Q99K46 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp11Q99K46 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp11Q99K46 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp11Q99K46 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp11Q99K46 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp11Q99K46 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp11Q99K46 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp11Q99K46 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms