Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW5

Epcam, Epithelial cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EpcamQ99JW5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms