Protein–RNA interactions for Protein: Q923U0

Tom1l1, TOM1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1l1Q923U0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tom1l1Q923U0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tom1l1Q923U0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tom1l1Q923U0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tom1l1Q923U0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tom1l1Q923U0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tom1l1Q923U0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tom1l1Q923U0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tom1l1Q923U0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tom1l1Q923U0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tom1l1Q923U0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tom1l1Q923U0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tom1l1Q923U0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tom1l1Q923U0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tom1l1Q923U0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tom1l1Q923U0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tom1l1Q923U0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tom1l1Q923U0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tom1l1Q923U0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tom1l1Q923U0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tom1l1Q923U0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tom1l1Q923U0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tom1l1Q923U0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tom1l1Q923U0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tom1l1Q923U0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tom1l1Q923U0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tom1l1Q923U0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tom1l1Q923U0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tom1l1Q923U0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tom1l1Q923U0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tom1l1Q923U0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tom1l1Q923U0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tom1l1Q923U0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tom1l1Q923U0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tom1l1Q923U0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tom1l1Q923U0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tom1l1Q923U0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tom1l1Q923U0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tom1l1Q923U0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tom1l1Q923U0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tom1l1Q923U0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tom1l1Q923U0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tom1l1Q923U0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tom1l1Q923U0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tom1l1Q923U0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tom1l1Q923U0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tom1l1Q923U0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tom1l1Q923U0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tom1l1Q923U0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tom1l1Q923U0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tom1l1Q923U0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tom1l1Q923U0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tom1l1Q923U0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tom1l1Q923U0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tom1l1Q923U0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tom1l1Q923U0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tom1l1Q923U0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tom1l1Q923U0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tom1l1Q923U0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tom1l1Q923U0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tom1l1Q923U0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tom1l1Q923U0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tom1l1Q923U0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tom1l1Q923U0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tom1l1Q923U0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tom1l1Q923U0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tom1l1Q923U0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tom1l1Q923U0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tom1l1Q923U0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tom1l1Q923U0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tom1l1Q923U0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tom1l1Q923U0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tom1l1Q923U0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tom1l1Q923U0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tom1l1Q923U0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tom1l1Q923U0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tom1l1Q923U0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tom1l1Q923U0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tom1l1Q923U0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tom1l1Q923U0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tom1l1Q923U0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tom1l1Q923U0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tom1l1Q923U0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tom1l1Q923U0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tom1l1Q923U0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tom1l1Q923U0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tom1l1Q923U0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tom1l1Q923U0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tom1l1Q923U0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tom1l1Q923U0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tom1l1Q923U0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tom1l1Q923U0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tom1l1Q923U0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tom1l1Q923U0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tom1l1Q923U0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tom1l1Q923U0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tom1l1Q923U0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tom1l1Q923U0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tom1l1Q923U0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tom1l1Q923U0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms