Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarca5Q91ZW3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarca5Q91ZW3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarca5Q91ZW3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarca5Q91ZW3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarca5Q91ZW3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarca5Q91ZW3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smarca5Q91ZW3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smarca5Q91ZW3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smarca5Q91ZW3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smarca5Q91ZW3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smarca5Q91ZW3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smarca5Q91ZW3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarca5Q91ZW3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarca5Q91ZW3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarca5Q91ZW3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarca5Q91ZW3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarca5Q91ZW3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarca5Q91ZW3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarca5Q91ZW3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarca5Q91ZW3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarca5Q91ZW3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarca5Q91ZW3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarca5Q91ZW3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarca5Q91ZW3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarca5Q91ZW3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarca5Q91ZW3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smarca5Q91ZW3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smarca5Q91ZW3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smarca5Q91ZW3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smarca5Q91ZW3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smarca5Q91ZW3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smarca5Q91ZW3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smarca5Q91ZW3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarca5Q91ZW3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarca5Q91ZW3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarca5Q91ZW3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarca5Q91ZW3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarca5Q91ZW3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarca5Q91ZW3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarca5Q91ZW3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smarca5Q91ZW3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smarca5Q91ZW3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smarca5Q91ZW3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smarca5Q91ZW3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarca5Q91ZW3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarca5Q91ZW3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarca5Q91ZW3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarca5Q91ZW3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarca5Q91ZW3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarca5Q91ZW3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarca5Q91ZW3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarca5Q91ZW3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarca5Q91ZW3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarca5Q91ZW3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarca5Q91ZW3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarca5Q91ZW3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarca5Q91ZW3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarca5Q91ZW3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarca5Q91ZW3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarca5Q91ZW3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarca5Q91ZW3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarca5Q91ZW3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarca5Q91ZW3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarca5Q91ZW3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarca5Q91ZW3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarca5Q91ZW3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarca5Q91ZW3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarca5Q91ZW3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarca5Q91ZW3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarca5Q91ZW3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarca5Q91ZW3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarca5Q91ZW3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarca5Q91ZW3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarca5Q91ZW3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarca5Q91ZW3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarca5Q91ZW3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarca5Q91ZW3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarca5Q91ZW3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarca5Q91ZW3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarca5Q91ZW3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarca5Q91ZW3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarca5Q91ZW3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarca5Q91ZW3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarca5Q91ZW3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarca5Q91ZW3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarca5Q91ZW3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarca5Q91ZW3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarca5Q91ZW3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Smarca5Q91ZW3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Smarca5Q91ZW3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Smarca5Q91ZW3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Smarca5Q91ZW3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Smarca5Q91ZW3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smarca5Q91ZW3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smarca5Q91ZW3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smarca5Q91ZW3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smarca5Q91ZW3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarca5Q91ZW3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarca5Q91ZW3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms