Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp3Q91W36 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp3Q91W36 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp3Q91W36 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp3Q91W36 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp3Q91W36 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp3Q91W36 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp3Q91W36 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp3Q91W36 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp3Q91W36 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp3Q91W36 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp3Q91W36 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp3Q91W36 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp3Q91W36 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp3Q91W36 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp3Q91W36 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp3Q91W36 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp3Q91W36 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp3Q91W36 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp3Q91W36 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp3Q91W36 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp3Q91W36 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp3Q91W36 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp3Q91W36 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp3Q91W36 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp3Q91W36 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp3Q91W36 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp3Q91W36 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp3Q91W36 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp3Q91W36 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp3Q91W36 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp3Q91W36 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp3Q91W36 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp3Q91W36 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp3Q91W36 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp3Q91W36 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp3Q91W36 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp3Q91W36 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp3Q91W36 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp3Q91W36 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp3Q91W36 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp3Q91W36 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp3Q91W36 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp3Q91W36 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp3Q91W36 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp3Q91W36 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp3Q91W36 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp3Q91W36 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp3Q91W36 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp3Q91W36 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp3Q91W36 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp3Q91W36 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp3Q91W36 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp3Q91W36 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp3Q91W36 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp3Q91W36 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp3Q91W36 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp3Q91W36 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp3Q91W36 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp3Q91W36 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp3Q91W36 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp3Q91W36 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp3Q91W36 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp3Q91W36 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp3Q91W36 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp3Q91W36 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp3Q91W36 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp3Q91W36 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp3Q91W36 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Usp3Q91W36 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp3Q91W36 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp3Q91W36 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp3Q91W36 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp3Q91W36 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp3Q91W36 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp3Q91W36 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp3Q91W36 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp3Q91W36 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp3Q91W36 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp3Q91W36 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp3Q91W36 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp3Q91W36 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp3Q91W36 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp3Q91W36 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp3Q91W36 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp3Q91W36 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp3Q91W36 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp3Q91W36 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp3Q91W36 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp3Q91W36 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp3Q91W36 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp3Q91W36 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp3Q91W36 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp3Q91W36 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp3Q91W36 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp3Q91W36 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp3Q91W36 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp3Q91W36 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp3Q91W36 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp3Q91W36 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms