Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx9Q91VH2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx9Q91VH2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx9Q91VH2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx9Q91VH2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx9Q91VH2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx9Q91VH2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx9Q91VH2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx9Q91VH2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx9Q91VH2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx9Q91VH2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx9Q91VH2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx9Q91VH2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx9Q91VH2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx9Q91VH2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx9Q91VH2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx9Q91VH2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx9Q91VH2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx9Q91VH2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx9Q91VH2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx9Q91VH2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx9Q91VH2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx9Q91VH2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx9Q91VH2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx9Q91VH2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx9Q91VH2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx9Q91VH2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx9Q91VH2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx9Q91VH2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx9Q91VH2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx9Q91VH2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx9Q91VH2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx9Q91VH2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx9Q91VH2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Snx9Q91VH2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx9Q91VH2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx9Q91VH2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx9Q91VH2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx9Q91VH2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx9Q91VH2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx9Q91VH2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx9Q91VH2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx9Q91VH2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx9Q91VH2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx9Q91VH2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx9Q91VH2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx9Q91VH2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx9Q91VH2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx9Q91VH2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx9Q91VH2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx9Q91VH2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx9Q91VH2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx9Q91VH2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx9Q91VH2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx9Q91VH2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx9Q91VH2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx9Q91VH2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx9Q91VH2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx9Q91VH2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx9Q91VH2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx9Q91VH2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx9Q91VH2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx9Q91VH2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx9Q91VH2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx9Q91VH2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx9Q91VH2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx9Q91VH2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx9Q91VH2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx9Q91VH2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx9Q91VH2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx9Q91VH2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx9Q91VH2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx9Q91VH2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx9Q91VH2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx9Q91VH2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx9Q91VH2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx9Q91VH2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx9Q91VH2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx9Q91VH2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Snx9Q91VH2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx9Q91VH2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx9Q91VH2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx9Q91VH2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx9Q91VH2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx9Q91VH2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx9Q91VH2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx9Q91VH2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx9Q91VH2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx9Q91VH2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx9Q91VH2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx9Q91VH2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx9Q91VH2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx9Q91VH2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx9Q91VH2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx9Q91VH2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx9Q91VH2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx9Q91VH2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx9Q91VH2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx9Q91VH2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx9Q91VH2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms