Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM9

Klhdc3, Kelch domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc3Q8VEM9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhdc3Q8VEM9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhdc3Q8VEM9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhdc3Q8VEM9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhdc3Q8VEM9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhdc3Q8VEM9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhdc3Q8VEM9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhdc3Q8VEM9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhdc3Q8VEM9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhdc3Q8VEM9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhdc3Q8VEM9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhdc3Q8VEM9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhdc3Q8VEM9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhdc3Q8VEM9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhdc3Q8VEM9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhdc3Q8VEM9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhdc3Q8VEM9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhdc3Q8VEM9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhdc3Q8VEM9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhdc3Q8VEM9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhdc3Q8VEM9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhdc3Q8VEM9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhdc3Q8VEM9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhdc3Q8VEM9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhdc3Q8VEM9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhdc3Q8VEM9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhdc3Q8VEM9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhdc3Q8VEM9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klhdc3Q8VEM9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klhdc3Q8VEM9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klhdc3Q8VEM9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klhdc3Q8VEM9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klhdc3Q8VEM9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhdc3Q8VEM9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klhdc3Q8VEM9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klhdc3Q8VEM9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klhdc3Q8VEM9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klhdc3Q8VEM9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms