Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEE1

Lmcd1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmcd1Q8VEE1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmcd1Q8VEE1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmcd1Q8VEE1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmcd1Q8VEE1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmcd1Q8VEE1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmcd1Q8VEE1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmcd1Q8VEE1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmcd1Q8VEE1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmcd1Q8VEE1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmcd1Q8VEE1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmcd1Q8VEE1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmcd1Q8VEE1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmcd1Q8VEE1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmcd1Q8VEE1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmcd1Q8VEE1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmcd1Q8VEE1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmcd1Q8VEE1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmcd1Q8VEE1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmcd1Q8VEE1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lmcd1Q8VEE1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmcd1Q8VEE1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmcd1Q8VEE1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmcd1Q8VEE1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmcd1Q8VEE1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmcd1Q8VEE1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmcd1Q8VEE1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmcd1Q8VEE1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmcd1Q8VEE1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmcd1Q8VEE1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmcd1Q8VEE1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmcd1Q8VEE1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmcd1Q8VEE1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmcd1Q8VEE1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmcd1Q8VEE1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmcd1Q8VEE1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmcd1Q8VEE1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmcd1Q8VEE1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmcd1Q8VEE1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmcd1Q8VEE1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmcd1Q8VEE1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmcd1Q8VEE1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmcd1Q8VEE1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmcd1Q8VEE1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmcd1Q8VEE1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmcd1Q8VEE1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmcd1Q8VEE1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmcd1Q8VEE1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmcd1Q8VEE1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmcd1Q8VEE1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmcd1Q8VEE1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmcd1Q8VEE1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmcd1Q8VEE1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmcd1Q8VEE1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmcd1Q8VEE1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmcd1Q8VEE1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmcd1Q8VEE1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmcd1Q8VEE1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmcd1Q8VEE1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmcd1Q8VEE1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmcd1Q8VEE1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmcd1Q8VEE1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmcd1Q8VEE1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lmcd1Q8VEE1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmcd1Q8VEE1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmcd1Q8VEE1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmcd1Q8VEE1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmcd1Q8VEE1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmcd1Q8VEE1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmcd1Q8VEE1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmcd1Q8VEE1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmcd1Q8VEE1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmcd1Q8VEE1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmcd1Q8VEE1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmcd1Q8VEE1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmcd1Q8VEE1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmcd1Q8VEE1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmcd1Q8VEE1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmcd1Q8VEE1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmcd1Q8VEE1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmcd1Q8VEE1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmcd1Q8VEE1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmcd1Q8VEE1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmcd1Q8VEE1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmcd1Q8VEE1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmcd1Q8VEE1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmcd1Q8VEE1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmcd1Q8VEE1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmcd1Q8VEE1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmcd1Q8VEE1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmcd1Q8VEE1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmcd1Q8VEE1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmcd1Q8VEE1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmcd1Q8VEE1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmcd1Q8VEE1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmcd1Q8VEE1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmcd1Q8VEE1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmcd1Q8VEE1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmcd1Q8VEE1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmcd1Q8VEE1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmcd1Q8VEE1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms