Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc8Q8VD72 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc8Q8VD72 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc8Q8VD72 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc8Q8VD72 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc8Q8VD72 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc8Q8VD72 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc8Q8VD72 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc8Q8VD72 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc8Q8VD72 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc8Q8VD72 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc8Q8VD72 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc8Q8VD72 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc8Q8VD72 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc8Q8VD72 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc8Q8VD72 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ttc8Q8VD72 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ttc8Q8VD72 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ttc8Q8VD72 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ttc8Q8VD72 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ttc8Q8VD72 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ttc8Q8VD72 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ttc8Q8VD72 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ttc8Q8VD72 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ttc8Q8VD72 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc8Q8VD72 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc8Q8VD72 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc8Q8VD72 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc8Q8VD72 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc8Q8VD72 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc8Q8VD72 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc8Q8VD72 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc8Q8VD72 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc8Q8VD72 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc8Q8VD72 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc8Q8VD72 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc8Q8VD72 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttc8Q8VD72 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttc8Q8VD72 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttc8Q8VD72 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttc8Q8VD72 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttc8Q8VD72 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttc8Q8VD72 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttc8Q8VD72 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttc8Q8VD72 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttc8Q8VD72 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttc8Q8VD72 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttc8Q8VD72 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttc8Q8VD72 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttc8Q8VD72 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttc8Q8VD72 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttc8Q8VD72 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttc8Q8VD72 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttc8Q8VD72 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttc8Q8VD72 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttc8Q8VD72 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttc8Q8VD72 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttc8Q8VD72 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttc8Q8VD72 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttc8Q8VD72 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttc8Q8VD72 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttc8Q8VD72 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttc8Q8VD72 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc8Q8VD72 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc8Q8VD72 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc8Q8VD72 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc8Q8VD72 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc8Q8VD72 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc8Q8VD72 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc8Q8VD72 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc8Q8VD72 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttc8Q8VD72 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttc8Q8VD72 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttc8Q8VD72 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttc8Q8VD72 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttc8Q8VD72 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttc8Q8VD72 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttc8Q8VD72 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttc8Q8VD72 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttc8Q8VD72 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttc8Q8VD72 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttc8Q8VD72 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttc8Q8VD72 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttc8Q8VD72 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttc8Q8VD72 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttc8Q8VD72 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttc8Q8VD72 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttc8Q8VD72 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttc8Q8VD72 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttc8Q8VD72 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttc8Q8VD72 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttc8Q8VD72 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttc8Q8VD72 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttc8Q8VD72 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttc8Q8VD72 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttc8Q8VD72 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttc8Q8VD72 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttc8Q8VD72 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttc8Q8VD72 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttc8Q8VD72 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms