Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnajc28Q8VCE1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnajc28Q8VCE1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnajc28Q8VCE1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnajc28Q8VCE1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnajc28Q8VCE1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnajc28Q8VCE1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnajc28Q8VCE1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnajc28Q8VCE1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnajc28Q8VCE1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnajc28Q8VCE1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnajc28Q8VCE1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnajc28Q8VCE1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnajc28Q8VCE1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnajc28Q8VCE1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnajc28Q8VCE1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnajc28Q8VCE1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnajc28Q8VCE1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnajc28Q8VCE1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnajc28Q8VCE1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnajc28Q8VCE1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnajc28Q8VCE1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnajc28Q8VCE1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnajc28Q8VCE1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnajc28Q8VCE1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnajc28Q8VCE1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnajc28Q8VCE1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnajc28Q8VCE1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnajc28Q8VCE1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnajc28Q8VCE1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnajc28Q8VCE1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnajc28Q8VCE1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnajc28Q8VCE1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Dnajc28Q8VCE1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnajc28Q8VCE1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnajc28Q8VCE1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnajc28Q8VCE1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnajc28Q8VCE1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnajc28Q8VCE1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnajc28Q8VCE1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dnajc28Q8VCE1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dnajc28Q8VCE1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dnajc28Q8VCE1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Dnajc28Q8VCE1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dnajc28Q8VCE1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dnajc28Q8VCE1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dnajc28Q8VCE1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dnajc28Q8VCE1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dnajc28Q8VCE1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dnajc28Q8VCE1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Dnajc28Q8VCE1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dnajc28Q8VCE1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dnajc28Q8VCE1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dnajc28Q8VCE1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dnajc28Q8VCE1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dnajc28Q8VCE1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dnajc28Q8VCE1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dnajc28Q8VCE1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dnajc28Q8VCE1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dnajc28Q8VCE1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dnajc28Q8VCE1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dnajc28Q8VCE1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dnajc28Q8VCE1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dnajc28Q8VCE1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dnajc28Q8VCE1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dnajc28Q8VCE1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dnajc28Q8VCE1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dnajc28Q8VCE1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dnajc28Q8VCE1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dnajc28Q8VCE1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dnajc28Q8VCE1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dnajc28Q8VCE1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Dnajc28Q8VCE1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dnajc28Q8VCE1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dnajc28Q8VCE1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dnajc28Q8VCE1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dnajc28Q8VCE1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Dnajc28Q8VCE1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dnajc28Q8VCE1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dnajc28Q8VCE1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dnajc28Q8VCE1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dnajc28Q8VCE1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dnajc28Q8VCE1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dnajc28Q8VCE1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dnajc28Q8VCE1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dnajc28Q8VCE1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dnajc28Q8VCE1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dnajc28Q8VCE1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dnajc28Q8VCE1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dnajc28Q8VCE1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dnajc28Q8VCE1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dnajc28Q8VCE1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dnajc28Q8VCE1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dnajc28Q8VCE1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dnajc28Q8VCE1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dnajc28Q8VCE1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms