Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2T8

Gtf3c5, General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5Q8R2T8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf3c5Q8R2T8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf3c5Q8R2T8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf3c5Q8R2T8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf3c5Q8R2T8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf3c5Q8R2T8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf3c5Q8R2T8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf3c5Q8R2T8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtf3c5Q8R2T8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtf3c5Q8R2T8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtf3c5Q8R2T8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtf3c5Q8R2T8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtf3c5Q8R2T8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtf3c5Q8R2T8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtf3c5Q8R2T8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtf3c5Q8R2T8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtf3c5Q8R2T8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtf3c5Q8R2T8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtf3c5Q8R2T8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtf3c5Q8R2T8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtf3c5Q8R2T8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtf3c5Q8R2T8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtf3c5Q8R2T8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf3c5Q8R2T8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf3c5Q8R2T8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf3c5Q8R2T8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf3c5Q8R2T8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf3c5Q8R2T8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf3c5Q8R2T8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf3c5Q8R2T8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtf3c5Q8R2T8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtf3c5Q8R2T8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtf3c5Q8R2T8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtf3c5Q8R2T8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtf3c5Q8R2T8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtf3c5Q8R2T8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtf3c5Q8R2T8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtf3c5Q8R2T8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtf3c5Q8R2T8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtf3c5Q8R2T8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtf3c5Q8R2T8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtf3c5Q8R2T8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtf3c5Q8R2T8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtf3c5Q8R2T8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtf3c5Q8R2T8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtf3c5Q8R2T8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtf3c5Q8R2T8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtf3c5Q8R2T8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtf3c5Q8R2T8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtf3c5Q8R2T8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtf3c5Q8R2T8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtf3c5Q8R2T8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtf3c5Q8R2T8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtf3c5Q8R2T8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtf3c5Q8R2T8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtf3c5Q8R2T8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtf3c5Q8R2T8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf3c5Q8R2T8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf3c5Q8R2T8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf3c5Q8R2T8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf3c5Q8R2T8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf3c5Q8R2T8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf3c5Q8R2T8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf3c5Q8R2T8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf3c5Q8R2T8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf3c5Q8R2T8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf3c5Q8R2T8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf3c5Q8R2T8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf3c5Q8R2T8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf3c5Q8R2T8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf3c5Q8R2T8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gtf3c5Q8R2T8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gtf3c5Q8R2T8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gtf3c5Q8R2T8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gtf3c5Q8R2T8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gtf3c5Q8R2T8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gtf3c5Q8R2T8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gtf3c5Q8R2T8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gtf3c5Q8R2T8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gtf3c5Q8R2T8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf3c5Q8R2T8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf3c5Q8R2T8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf3c5Q8R2T8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf3c5Q8R2T8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf3c5Q8R2T8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf3c5Q8R2T8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf3c5Q8R2T8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf3c5Q8R2T8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf3c5Q8R2T8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf3c5Q8R2T8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf3c5Q8R2T8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf3c5Q8R2T8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf3c5Q8R2T8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf3c5Q8R2T8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf3c5Q8R2T8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf3c5Q8R2T8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf3c5Q8R2T8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf3c5Q8R2T8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf3c5Q8R2T8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf3c5Q8R2T8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms