Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0H9

Gga1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga1Q8R0H9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gga1Q8R0H9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gga1Q8R0H9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gga1Q8R0H9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gga1Q8R0H9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gga1Q8R0H9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gga1Q8R0H9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gga1Q8R0H9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gga1Q8R0H9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gga1Q8R0H9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gga1Q8R0H9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gga1Q8R0H9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gga1Q8R0H9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gga1Q8R0H9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gga1Q8R0H9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gga1Q8R0H9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gga1Q8R0H9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gga1Q8R0H9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gga1Q8R0H9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gga1Q8R0H9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gga1Q8R0H9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gga1Q8R0H9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gga1Q8R0H9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gga1Q8R0H9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gga1Q8R0H9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gga1Q8R0H9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gga1Q8R0H9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gga1Q8R0H9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gga1Q8R0H9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gga1Q8R0H9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gga1Q8R0H9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gga1Q8R0H9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gga1Q8R0H9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gga1Q8R0H9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gga1Q8R0H9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gga1Q8R0H9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gga1Q8R0H9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gga1Q8R0H9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gga1Q8R0H9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gga1Q8R0H9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gga1Q8R0H9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms