Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rnf183Q8QZS5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf183Q8QZS5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rnf183Q8QZS5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf183Q8QZS5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf183Q8QZS5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rnf183Q8QZS5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rnf183Q8QZS5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rnf183Q8QZS5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rnf183Q8QZS5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf183Q8QZS5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rnf183Q8QZS5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rnf183Q8QZS5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rnf183Q8QZS5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf183Q8QZS5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Rnf183Q8QZS5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf183Q8QZS5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf183Q8QZS5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf183Q8QZS5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf183Q8QZS5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf183Q8QZS5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf183Q8QZS5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf183Q8QZS5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf183Q8QZS5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf183Q8QZS5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf183Q8QZS5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf183Q8QZS5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf183Q8QZS5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf183Q8QZS5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf183Q8QZS5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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