Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Z0

Nod2, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nod2Q8K3Z0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nod2Q8K3Z0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nod2Q8K3Z0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nod2Q8K3Z0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Nod2Q8K3Z0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nod2Q8K3Z0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nod2Q8K3Z0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nod2Q8K3Z0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Nod2Q8K3Z0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Nod2Q8K3Z0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nod2Q8K3Z0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nod2Q8K3Z0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nod2Q8K3Z0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nod2Q8K3Z0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nod2Q8K3Z0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nod2Q8K3Z0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nod2Q8K3Z0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nod2Q8K3Z0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nod2Q8K3Z0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nod2Q8K3Z0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nod2Q8K3Z0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nod2Q8K3Z0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nod2Q8K3Z0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nod2Q8K3Z0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nod2Q8K3Z0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nod2Q8K3Z0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nod2Q8K3Z0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nod2Q8K3Z0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nod2Q8K3Z0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nod2Q8K3Z0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nod2Q8K3Z0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nod2Q8K3Z0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nod2Q8K3Z0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nod2Q8K3Z0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Nod2Q8K3Z0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Nod2Q8K3Z0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nod2Q8K3Z0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nod2Q8K3Z0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nod2Q8K3Z0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nod2Q8K3Z0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nod2Q8K3Z0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nod2Q8K3Z0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nod2Q8K3Z0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nod2Q8K3Z0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nod2Q8K3Z0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nod2Q8K3Z0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nod2Q8K3Z0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nod2Q8K3Z0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Nod2Q8K3Z0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nod2Q8K3Z0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nod2Q8K3Z0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nod2Q8K3Z0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nod2Q8K3Z0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nod2Q8K3Z0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nod2Q8K3Z0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nod2Q8K3Z0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nod2Q8K3Z0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nod2Q8K3Z0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nod2Q8K3Z0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nod2Q8K3Z0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nod2Q8K3Z0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nod2Q8K3Z0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nod2Q8K3Z0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nod2Q8K3Z0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nod2Q8K3Z0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nod2Q8K3Z0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nod2Q8K3Z0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nod2Q8K3Z0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nod2Q8K3Z0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nod2Q8K3Z0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nod2Q8K3Z0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Nod2Q8K3Z0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nod2Q8K3Z0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nod2Q8K3Z0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nod2Q8K3Z0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nod2Q8K3Z0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Nod2Q8K3Z0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Nod2Q8K3Z0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nod2Q8K3Z0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nod2Q8K3Z0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nod2Q8K3Z0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nod2Q8K3Z0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nod2Q8K3Z0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nod2Q8K3Z0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nod2Q8K3Z0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nod2Q8K3Z0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nod2Q8K3Z0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nod2Q8K3Z0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nod2Q8K3Z0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nod2Q8K3Z0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nod2Q8K3Z0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nod2Q8K3Z0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nod2Q8K3Z0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nod2Q8K3Z0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nod2Q8K3Z0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nod2Q8K3Z0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nod2Q8K3Z0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nod2Q8K3Z0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nod2Q8K3Z0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nod2Q8K3Z0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms