Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT1

Ngef, Ephexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgefQ8CHT1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NgefQ8CHT1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NgefQ8CHT1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NgefQ8CHT1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NgefQ8CHT1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NgefQ8CHT1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NgefQ8CHT1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NgefQ8CHT1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NgefQ8CHT1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NgefQ8CHT1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NgefQ8CHT1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NgefQ8CHT1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NgefQ8CHT1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NgefQ8CHT1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NgefQ8CHT1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NgefQ8CHT1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NgefQ8CHT1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NgefQ8CHT1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NgefQ8CHT1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NgefQ8CHT1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NgefQ8CHT1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
NgefQ8CHT1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NgefQ8CHT1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NgefQ8CHT1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NgefQ8CHT1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NgefQ8CHT1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NgefQ8CHT1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NgefQ8CHT1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NgefQ8CHT1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NgefQ8CHT1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NgefQ8CHT1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NgefQ8CHT1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NgefQ8CHT1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NgefQ8CHT1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NgefQ8CHT1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NgefQ8CHT1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NgefQ8CHT1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NgefQ8CHT1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NgefQ8CHT1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NgefQ8CHT1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NgefQ8CHT1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NgefQ8CHT1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NgefQ8CHT1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NgefQ8CHT1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NgefQ8CHT1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NgefQ8CHT1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NgefQ8CHT1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NgefQ8CHT1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NgefQ8CHT1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NgefQ8CHT1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NgefQ8CHT1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NgefQ8CHT1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NgefQ8CHT1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NgefQ8CHT1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NgefQ8CHT1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NgefQ8CHT1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NgefQ8CHT1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NgefQ8CHT1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NgefQ8CHT1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NgefQ8CHT1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NgefQ8CHT1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NgefQ8CHT1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NgefQ8CHT1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NgefQ8CHT1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NgefQ8CHT1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NgefQ8CHT1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NgefQ8CHT1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NgefQ8CHT1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NgefQ8CHT1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NgefQ8CHT1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NgefQ8CHT1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NgefQ8CHT1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NgefQ8CHT1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NgefQ8CHT1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NgefQ8CHT1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NgefQ8CHT1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NgefQ8CHT1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NgefQ8CHT1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NgefQ8CHT1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NgefQ8CHT1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NgefQ8CHT1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NgefQ8CHT1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NgefQ8CHT1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NgefQ8CHT1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NgefQ8CHT1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NgefQ8CHT1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NgefQ8CHT1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NgefQ8CHT1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NgefQ8CHT1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NgefQ8CHT1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NgefQ8CHT1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NgefQ8CHT1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NgefQ8CHT1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NgefQ8CHT1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NgefQ8CHT1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NgefQ8CHT1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NgefQ8CHT1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NgefQ8CHT1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NgefQ8CHT1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NgefQ8CHT1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 186.3 ms