Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGU1

Calcoco1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco1Q8CGU1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Calcoco1Q8CGU1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Calcoco1Q8CGU1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Calcoco1Q8CGU1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Calcoco1Q8CGU1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Calcoco1Q8CGU1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Calcoco1Q8CGU1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Calcoco1Q8CGU1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Calcoco1Q8CGU1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Calcoco1Q8CGU1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Calcoco1Q8CGU1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Calcoco1Q8CGU1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Calcoco1Q8CGU1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Calcoco1Q8CGU1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Calcoco1Q8CGU1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Calcoco1Q8CGU1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Calcoco1Q8CGU1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Calcoco1Q8CGU1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Calcoco1Q8CGU1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Calcoco1Q8CGU1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Calcoco1Q8CGU1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Calcoco1Q8CGU1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Calcoco1Q8CGU1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Calcoco1Q8CGU1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Calcoco1Q8CGU1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Calcoco1Q8CGU1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Calcoco1Q8CGU1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Calcoco1Q8CGU1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Calcoco1Q8CGU1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Calcoco1Q8CGU1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Calcoco1Q8CGU1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Calcoco1Q8CGU1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Calcoco1Q8CGU1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Calcoco1Q8CGU1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Calcoco1Q8CGU1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Calcoco1Q8CGU1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Calcoco1Q8CGU1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Calcoco1Q8CGU1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Calcoco1Q8CGU1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calcoco1Q8CGU1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calcoco1Q8CGU1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calcoco1Q8CGU1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calcoco1Q8CGU1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calcoco1Q8CGU1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calcoco1Q8CGU1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Calcoco1Q8CGU1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Calcoco1Q8CGU1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Calcoco1Q8CGU1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Calcoco1Q8CGU1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Calcoco1Q8CGU1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Calcoco1Q8CGU1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Calcoco1Q8CGU1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Calcoco1Q8CGU1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Calcoco1Q8CGU1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calcoco1Q8CGU1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calcoco1Q8CGU1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calcoco1Q8CGU1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calcoco1Q8CGU1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calcoco1Q8CGU1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calcoco1Q8CGU1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calcoco1Q8CGU1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calcoco1Q8CGU1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calcoco1Q8CGU1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calcoco1Q8CGU1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calcoco1Q8CGU1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calcoco1Q8CGU1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calcoco1Q8CGU1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calcoco1Q8CGU1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Calcoco1Q8CGU1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Calcoco1Q8CGU1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Calcoco1Q8CGU1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Calcoco1Q8CGU1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Calcoco1Q8CGU1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Calcoco1Q8CGU1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Calcoco1Q8CGU1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Calcoco1Q8CGU1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Calcoco1Q8CGU1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Calcoco1Q8CGU1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Calcoco1Q8CGU1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Calcoco1Q8CGU1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Calcoco1Q8CGU1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Calcoco1Q8CGU1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Calcoco1Q8CGU1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Calcoco1Q8CGU1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Calcoco1Q8CGU1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Calcoco1Q8CGU1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Calcoco1Q8CGU1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Calcoco1Q8CGU1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Calcoco1Q8CGU1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Calcoco1Q8CGU1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Calcoco1Q8CGU1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Calcoco1Q8CGU1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Calcoco1Q8CGU1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Calcoco1Q8CGU1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Calcoco1Q8CGU1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Calcoco1Q8CGU1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Calcoco1Q8CGU1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Calcoco1Q8CGU1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Calcoco1Q8CGU1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Calcoco1Q8CGU1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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