Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGM2

Rp1l1, Retinitis pigmentosa 1-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1l1Q8CGM2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rp1l1Q8CGM2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rp1l1Q8CGM2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rp1l1Q8CGM2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rp1l1Q8CGM2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rp1l1Q8CGM2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rp1l1Q8CGM2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rp1l1Q8CGM2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rp1l1Q8CGM2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rp1l1Q8CGM2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rp1l1Q8CGM2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rp1l1Q8CGM2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rp1l1Q8CGM2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rp1l1Q8CGM2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rp1l1Q8CGM2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rp1l1Q8CGM2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rp1l1Q8CGM2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rp1l1Q8CGM2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rp1l1Q8CGM2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rp1l1Q8CGM2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rp1l1Q8CGM2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rp1l1Q8CGM2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rp1l1Q8CGM2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rp1l1Q8CGM2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rp1l1Q8CGM2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rp1l1Q8CGM2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rp1l1Q8CGM2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rp1l1Q8CGM2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rp1l1Q8CGM2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rp1l1Q8CGM2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rp1l1Q8CGM2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rp1l1Q8CGM2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rp1l1Q8CGM2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rp1l1Q8CGM2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rp1l1Q8CGM2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rp1l1Q8CGM2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rp1l1Q8CGM2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rp1l1Q8CGM2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rp1l1Q8CGM2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rp1l1Q8CGM2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rp1l1Q8CGM2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rp1l1Q8CGM2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rp1l1Q8CGM2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rp1l1Q8CGM2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rp1l1Q8CGM2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rp1l1Q8CGM2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rp1l1Q8CGM2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rp1l1Q8CGM2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rp1l1Q8CGM2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rp1l1Q8CGM2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rp1l1Q8CGM2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rp1l1Q8CGM2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rp1l1Q8CGM2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rp1l1Q8CGM2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rp1l1Q8CGM2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rp1l1Q8CGM2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rp1l1Q8CGM2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rp1l1Q8CGM2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rp1l1Q8CGM2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rp1l1Q8CGM2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rp1l1Q8CGM2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rp1l1Q8CGM2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rp1l1Q8CGM2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rp1l1Q8CGM2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rp1l1Q8CGM2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rp1l1Q8CGM2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rp1l1Q8CGM2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rp1l1Q8CGM2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rp1l1Q8CGM2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rp1l1Q8CGM2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rp1l1Q8CGM2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rp1l1Q8CGM2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rp1l1Q8CGM2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rp1l1Q8CGM2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rp1l1Q8CGM2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rp1l1Q8CGM2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rp1l1Q8CGM2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rp1l1Q8CGM2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rp1l1Q8CGM2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rp1l1Q8CGM2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rp1l1Q8CGM2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rp1l1Q8CGM2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rp1l1Q8CGM2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rp1l1Q8CGM2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rp1l1Q8CGM2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rp1l1Q8CGM2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rp1l1Q8CGM2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rp1l1Q8CGM2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rp1l1Q8CGM2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rp1l1Q8CGM2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rp1l1Q8CGM2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rp1l1Q8CGM2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rp1l1Q8CGM2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rp1l1Q8CGM2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rp1l1Q8CGM2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rp1l1Q8CGM2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rp1l1Q8CGM2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rp1l1Q8CGM2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rp1l1Q8CGM2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rp1l1Q8CGM2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms