Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cdkl1Q8CEQ0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cdkl1Q8CEQ0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdkl1Q8CEQ0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdkl1Q8CEQ0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cdkl1Q8CEQ0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cdkl1Q8CEQ0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cdkl1Q8CEQ0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cdkl1Q8CEQ0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cdkl1Q8CEQ0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cdkl1Q8CEQ0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cdkl1Q8CEQ0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cdkl1Q8CEQ0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cdkl1Q8CEQ0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 302.2 ms