Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc178Q8CDV0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc178Q8CDV0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc178Q8CDV0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc178Q8CDV0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc178Q8CDV0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc178Q8CDV0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc178Q8CDV0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc178Q8CDV0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc178Q8CDV0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc178Q8CDV0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc178Q8CDV0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc178Q8CDV0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc178Q8CDV0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc178Q8CDV0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc178Q8CDV0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc178Q8CDV0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc178Q8CDV0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc178Q8CDV0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc178Q8CDV0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc178Q8CDV0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc178Q8CDV0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc178Q8CDV0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc178Q8CDV0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc178Q8CDV0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc178Q8CDV0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc178Q8CDV0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc178Q8CDV0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc178Q8CDV0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc178Q8CDV0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc178Q8CDV0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc178Q8CDV0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc178Q8CDV0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc178Q8CDV0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc178Q8CDV0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc178Q8CDV0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc178Q8CDV0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc178Q8CDV0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc178Q8CDV0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc178Q8CDV0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc178Q8CDV0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc178Q8CDV0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc178Q8CDV0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc178Q8CDV0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc178Q8CDV0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc178Q8CDV0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc178Q8CDV0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc178Q8CDV0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc178Q8CDV0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc178Q8CDV0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc178Q8CDV0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc178Q8CDV0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc178Q8CDV0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc178Q8CDV0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc178Q8CDV0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc178Q8CDV0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc178Q8CDV0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc178Q8CDV0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc178Q8CDV0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc178Q8CDV0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc178Q8CDV0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc178Q8CDV0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc178Q8CDV0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc178Q8CDV0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc178Q8CDV0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc178Q8CDV0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc178Q8CDV0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc178Q8CDV0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc178Q8CDV0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc178Q8CDV0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc178Q8CDV0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc178Q8CDV0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc178Q8CDV0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc178Q8CDV0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc178Q8CDV0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc178Q8CDV0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc178Q8CDV0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc178Q8CDV0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc178Q8CDV0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc178Q8CDV0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc178Q8CDV0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc178Q8CDV0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc178Q8CDV0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc178Q8CDV0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc178Q8CDV0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc178Q8CDV0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc178Q8CDV0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc178Q8CDV0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc178Q8CDV0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc178Q8CDV0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc178Q8CDV0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc178Q8CDV0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc178Q8CDV0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc178Q8CDV0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc178Q8CDV0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc178Q8CDV0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc178Q8CDV0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc178Q8CDV0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc178Q8CDV0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc178Q8CDV0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms