Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDU6

Hectd2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD2, mousemouse

Predictions only

Length 774 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd2Q8CDU6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hectd2Q8CDU6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hectd2Q8CDU6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Hectd2Q8CDU6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hectd2Q8CDU6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Hectd2Q8CDU6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Hectd2Q8CDU6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hectd2Q8CDU6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hectd2Q8CDU6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hectd2Q8CDU6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hectd2Q8CDU6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hectd2Q8CDU6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hectd2Q8CDU6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hectd2Q8CDU6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hectd2Q8CDU6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hectd2Q8CDU6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hectd2Q8CDU6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Hectd2Q8CDU6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hectd2Q8CDU6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hectd2Q8CDU6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hectd2Q8CDU6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hectd2Q8CDU6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hectd2Q8CDU6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hectd2Q8CDU6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hectd2Q8CDU6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hectd2Q8CDU6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hectd2Q8CDU6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hectd2Q8CDU6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hectd2Q8CDU6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hectd2Q8CDU6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hectd2Q8CDU6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hectd2Q8CDU6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hectd2Q8CDU6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hectd2Q8CDU6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hectd2Q8CDU6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Hectd2Q8CDU6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hectd2Q8CDU6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hectd2Q8CDU6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hectd2Q8CDU6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hectd2Q8CDU6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hectd2Q8CDU6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hectd2Q8CDU6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hectd2Q8CDU6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms