Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrrn3Q8CBC6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrrn3Q8CBC6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrrn3Q8CBC6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrrn3Q8CBC6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrn3Q8CBC6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrn3Q8CBC6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrn3Q8CBC6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrn3Q8CBC6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrn3Q8CBC6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrn3Q8CBC6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrn3Q8CBC6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrn3Q8CBC6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrn3Q8CBC6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lrrn3Q8CBC6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lrrn3Q8CBC6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Lrrn3Q8CBC6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrn3Q8CBC6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms