Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp20Q8C6M1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp20Q8C6M1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp20Q8C6M1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp20Q8C6M1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp20Q8C6M1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp20Q8C6M1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp20Q8C6M1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp20Q8C6M1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp20Q8C6M1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp20Q8C6M1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp20Q8C6M1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp20Q8C6M1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp20Q8C6M1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp20Q8C6M1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp20Q8C6M1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp20Q8C6M1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp20Q8C6M1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp20Q8C6M1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp20Q8C6M1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp20Q8C6M1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp20Q8C6M1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp20Q8C6M1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp20Q8C6M1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp20Q8C6M1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp20Q8C6M1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp20Q8C6M1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp20Q8C6M1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp20Q8C6M1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp20Q8C6M1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp20Q8C6M1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp20Q8C6M1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp20Q8C6M1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp20Q8C6M1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp20Q8C6M1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp20Q8C6M1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp20Q8C6M1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Usp20Q8C6M1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp20Q8C6M1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Usp20Q8C6M1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp20Q8C6M1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp20Q8C6M1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp20Q8C6M1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp20Q8C6M1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp20Q8C6M1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp20Q8C6M1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp20Q8C6M1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp20Q8C6M1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp20Q8C6M1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp20Q8C6M1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp20Q8C6M1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp20Q8C6M1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp20Q8C6M1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp20Q8C6M1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp20Q8C6M1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp20Q8C6M1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp20Q8C6M1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp20Q8C6M1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp20Q8C6M1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp20Q8C6M1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp20Q8C6M1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp20Q8C6M1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp20Q8C6M1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp20Q8C6M1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp20Q8C6M1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp20Q8C6M1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp20Q8C6M1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp20Q8C6M1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp20Q8C6M1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp20Q8C6M1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp20Q8C6M1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Usp20Q8C6M1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Usp20Q8C6M1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp20Q8C6M1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp20Q8C6M1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp20Q8C6M1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp20Q8C6M1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp20Q8C6M1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp20Q8C6M1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp20Q8C6M1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp20Q8C6M1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp20Q8C6M1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp20Q8C6M1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp20Q8C6M1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp20Q8C6M1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp20Q8C6M1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp20Q8C6M1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp20Q8C6M1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp20Q8C6M1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp20Q8C6M1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp20Q8C6M1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp20Q8C6M1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp20Q8C6M1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp20Q8C6M1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp20Q8C6M1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp20Q8C6M1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp20Q8C6M1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp20Q8C6M1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp20Q8C6M1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp20Q8C6M1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
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