Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6C7

Fam204a, Protein FAM204A, mousemouse

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Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam204aQ8C6C7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam204aQ8C6C7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam204aQ8C6C7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fam204aQ8C6C7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam204aQ8C6C7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam204aQ8C6C7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fam204aQ8C6C7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam204aQ8C6C7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Fam204aQ8C6C7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam204aQ8C6C7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam204aQ8C6C7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam204aQ8C6C7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam204aQ8C6C7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam204aQ8C6C7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam204aQ8C6C7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam204aQ8C6C7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam204aQ8C6C7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam204aQ8C6C7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam204aQ8C6C7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam204aQ8C6C7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam204aQ8C6C7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam204aQ8C6C7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam204aQ8C6C7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam204aQ8C6C7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam204aQ8C6C7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam204aQ8C6C7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam204aQ8C6C7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam204aQ8C6C7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam204aQ8C6C7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam204aQ8C6C7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam204aQ8C6C7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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Fam204aQ8C6C7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam204aQ8C6C7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam204aQ8C6C7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam204aQ8C6C7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam204aQ8C6C7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam204aQ8C6C7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam204aQ8C6C7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam204aQ8C6C7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam204aQ8C6C7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam204aQ8C6C7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam204aQ8C6C7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam204aQ8C6C7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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Fam204aQ8C6C7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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Fam204aQ8C6C7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam204aQ8C6C7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam204aQ8C6C7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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Fam204aQ8C6C7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam204aQ8C6C7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam204aQ8C6C7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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Fam204aQ8C6C7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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Fam204aQ8C6C7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam204aQ8C6C7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam204aQ8C6C7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam204aQ8C6C7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Fam204aQ8C6C7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Fam204aQ8C6C7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam204aQ8C6C7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam204aQ8C6C7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam204aQ8C6C7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam204aQ8C6C7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Fam204aQ8C6C7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam204aQ8C6C7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam204aQ8C6C7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam204aQ8C6C7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam204aQ8C6C7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam204aQ8C6C7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam204aQ8C6C7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam204aQ8C6C7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam204aQ8C6C7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam204aQ8C6C7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam204aQ8C6C7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam204aQ8C6C7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam204aQ8C6C7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam204aQ8C6C7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam204aQ8C6C7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam204aQ8C6C7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam204aQ8C6C7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam204aQ8C6C7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam204aQ8C6C7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam204aQ8C6C7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam204aQ8C6C7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam204aQ8C6C7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam204aQ8C6C7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms